Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CGGBP1Q9UFW8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms