Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAPAQ9P0L0 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms