Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX15Q9NRS6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX15Q9NRS6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms