Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NECTIN3Q9NQS3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms