Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDM5DQ9BY66 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms