Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTDSS2Q9BVG9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms