Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM79Q9BSE2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms