Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOPXQ9BPY8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms