Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
PRAC1Q96KF2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ELMO1-201ENST00000310758 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RNF217-210ENST00000521654 11325 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SLC14A1-205ENST00000502059 2371 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
PRAC1Q96KF2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms