Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2E3Q969T4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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UBE2E3Q969T4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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UBE2E3Q969T4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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UBE2E3Q969T4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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UBE2E3Q969T4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E3Q969T4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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