Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF3C6Q969F1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF3C6Q969F1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms