Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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SPC24Q8NBT2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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SPC24Q8NBT2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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SPC24Q8NBT2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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SPC24Q8NBT2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPC24Q8NBT2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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