Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARP8Q8N3A8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms