Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC80Q76M96 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC80Q76M96 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms