Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
XIRP1Q702N8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XIRP1Q702N8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms