Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C16orf54Q6UWD8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms