Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPN5Q6U736 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms