Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms