Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2H8

TMEM53, Transmembrane protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM53Q6P2H8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM53Q6P2H8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms