Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3F3CQ6NXT2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms