Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CSPP1Q1MSJ5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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