Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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