Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXT1Q16394 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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EXT1Q16394 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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EXT1Q16394 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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EXT1Q16394 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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EXT1Q16394 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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