Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA3Q16281 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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