Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC6Q16204 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms