Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SYCP1Q15431 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SYCP1Q15431 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SYCP1Q15431 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SYCP1Q15431 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SYCP1Q15431 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SYCP1Q15431 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SYCP1Q15431 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SYCP1Q15431 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SYCP1Q15431 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SYCP1Q15431 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SYCP1Q15431 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYCP1Q15431 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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