Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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IRF4Q15306 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF4Q15306 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms