Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDGFRLQ15198 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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