Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFIXQ14938 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms