Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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CHD4Q14839 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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CHD4Q14839 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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CHD4Q14839 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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CHD4Q14839 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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CHD4Q14839 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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CHD4Q14839 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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CHD4Q14839 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHD4Q14839 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
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