Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MELKQ14680 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MELKQ14680 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MELKQ14680 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MELKQ14680 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MELKQ14680 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MELKQ14680 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MELKQ14680 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MELKQ14680 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms