Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTK7Q13308 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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