Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIK3Q13003 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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