Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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