Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HSPB3Q12988 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HSPB3Q12988 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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