Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC15Q0P6D6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms