Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPN12Q05209 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTPN12Q05209 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms