Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PLOD1Q02809 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms