Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ID3Q02535 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ID3Q02535 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ID3Q02535 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ID3Q02535 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ID3Q02535 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ID3Q02535 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ID3Q02535 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ID3Q02535 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ID3Q02535 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ID3Q02535 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ID3Q02535 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms