Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TNFRSF17Q02223 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms