Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPIBQ01892 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPIBQ01892 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms