Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MC1RQ01726 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms