Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK16Q00536 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms