Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VLDLRP98155 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms