Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CSNK2A1P68400 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms