Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA9P57773 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA9P57773 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJA9P57773 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms