Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMD4P55036 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms