Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
POLR2KP53803 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
POLR2KP53803 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms