Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TAF6P49848 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TAF6P49848 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TAF6P49848 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms