Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAL1P37235 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms